将cmake与Enthow一起用于python包装

我最近开始尝试从ipython笔记本电脑切换到canopy，我从MATLAB切换到了。我正在努力获得类似matlab的开发和研究经验

我正在跨平台进行这些设置，但我是从OSX开始的

我一直在尝试安装在canopy中使用的软件包，其中一些需要编译，比如SimpleTk和VTK6.0。我已经在常规的python2.7安装中成功地安装了这两个组件，但是在为canopy安装它们时遇到了一些问题。现在，我正在用CMAKE重新编译simpletk/Superbuild，以重新创建python包装器。它要求提供python可执行文件include dir和python库位置。我发现python可以从casopy中的sys.executable执行，include dir带有'mdfind-name python.h，这是默认位置，我使用了默认的python库

这些是

可执行的：/Users/jmerkow/Library/enthund/Canopy_64bit/User/bin/python

包括：/System/Library/Frameworks/Python.framework/Headers

Lib:/usr/Lib/libpython2.7.dylib

但我在make时得到以下错误：

AssertionError: Filename /Applications/Canopy.app/appdata/canopy-1.1.0.1371.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/lib/python2.7/os.py does not start with any of these prefixes: ['/Users/jmerkow/Library/Enthought/Canopy_64bit/User', '/Library/Python/2.7/site-packages', '/Users/jmerkow/Library/Enthought/Canopy_64bit/User/Extras/lib/python', '/Users/jmerkow/Library/Python/2.7/site-packages', '/Users/jmerkow/.local/lib/python/2.7/site-packages', '/Users/jmerkow/Library/Python/2.7/lib/python/site-packages']
ERROR
-- Installing numpy from  /Users/jmerkow/Library/Enthought/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-packages/numpy to /numpy
ERROR
/bin/sh: ../Testing/Installation/PythonVirtualenv/bin/python: No such file or directory
make[5]: *** [lib/_SimpleITK.so] Error 127
make[4]: *** [Wrapping/CMakeFiles/SimpleITK_PYTHON.dir/all] Error 2
make[3]: *** [all] Error 2
make[2]: *** [SimpleITK-prefix/src/SimpleITK-stamp/SimpleITK-build] Error 2
make[1]: *** [CMakeFiles/SimpleITK.dir/all] Error 2
make: *** [all] Error 2

此外，任何其他帮助我完成这项工作的建议都是非常受欢迎的

编辑如下

因此，我尝试使用以下方法进行编译：

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin/Python /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/include/python2.7/ /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/lib/libpython2.7.dylib

此文件已编译并创建，文件名为

SimpleTk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg

但是当我使用enpkg时，我得到了以下错误

回溯（最近一次呼叫最后一次）： 文件“/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/User/bin/enpkg”，第10行，在 sys.exit（main（）） 文件“/Applications/Canopy.app/appdata/Canopy-1.1.0.1371.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/lib/python2.7/site packages/enshiller/main.py”，主文件第702行 请求追加（请求（名称+版本）） 文件“/Applications/Canopy.app/appdata/Canopy-1.1.0.1371.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/lib/python2.7/site packages/enshiller/resolve.py”，第32行，ininit 引发异常（“不是有效的要求：%r”%req\u字符串） 例外：无效要求：“SimpleTk 0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg”

使用easy_install，我遇到以下错误：

处理SimpleTk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg 删除“/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site packages/simpletk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg”（及其下的所有内容） 创建/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-packages/simpletk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg 将SimpleTk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg提取到/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-packages SimpleTk 0.7.0.dev88-ge297c已经是easy-install.pth中的活动版本

Installed/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-packages/simpletk-0.7.0.dev88_ge297c-py2.7-macosx-10.8-intel.egg SimpleTk的处理依赖项==0.7.0.dev88-ge297c 搜索SimpleTk==0.7.0.dev88-ge297c 阅读超链接 阅读超链接 阅读超链接 找不到SimpleTk==0.7.0.dev88-ge297c的本地包或下载链接 错误：找不到适合Requirement.parse的分发（'SimpleTk==0.7.0.dev88-ge297c'）

看起来是我安装的，所以我尝试导入：

导入SimpleTk

致命的Python错误：PyThreadState\u Get:没有当前线程

中止陷阱：6

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您已经将SimpleTk配置为使用系统python可执行文件、库和包含文件。但是，您正在尝试使用树冠分布。它们不是二进制兼容的，不匹配导致了这种类型的程序终止

已正确找到可执行文件： /Users/jmerkow/Library/enthund/Canopy_64bit/User/bin/python

但是您需要使PYTHON_INCLUDE_DIR和PYTHON_库保持一致。请尝试以下命令以帮助您确定正确的路径：

find/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/-name Python.h find/Users/jmerkow/Library/enthught/Canopy_64bit/-name lib python*.dylib