R 在data.table中查找多个范围的重叠
我想找到data.table对象中给定行的多个范围的重叠部分 例如:R 在data.table中查找多个范围的重叠,r,dataframe,data.table,overlap,R,Dataframe,Data.table,Overlap,我想找到data.table对象中给定行的多个范围的重叠部分 例如: t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19)) 如果可能的话,我真的很想这样做 作为本例的输出,我希望: t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19), o.l = c(5,5,5), o.r = c(12,12,12)) t以下是一个单行示例: library(data.table) dt = data.table
t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
如果可能的话,我真的很想这样做
作为本例的输出,我希望:
t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19), o.l = c(5,5,5), o.r = c(12,12,12))
t以下是一个单行示例:
library(data.table)
dt = data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
dt[, c("o.l", "o.r") := as.list(range(Reduce(intersect, mapply(seq, a, b, 1))))]
dt
# a b o.l o.r
# 1: 3 13 5 12
# 2: 4 12 5 12
# 3: 5 19 5 12
问题的核心在哪里
dt = data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
dt[, Reduce(intersect, mapply(seq, a, b, 1))]
# [1] 5 6 7 8 9 10 11 12
借鉴David Aurenburg的观点,这里有另一种可能的方法:
DT[, g := c(0L, cumsum(shift(a, -1L) >= cummax(b))[-.N])][,
c("ol", "or") := .(max(a), min(b)), g]
数据:
检查foverlaps
我已经使用foverlaps连接了两个data.table,但是现在不知道如何在这个上下文中应用它data.table(a=c(3,4,5),b=c(13,12,19))[,(max(a),min(b))]
谢谢你,这个例子当然可以。我也对这个问题作了一些修改,以解释那个案例
DT[, g := c(0L, cumsum(shift(a, -1L) >= cummax(b))[-.N])][,
c("ol", "or") := .(max(a), min(b)), g]
DT <- data.table(a = c(3,4,5,19,20,24), b = c(13,12,19,22,23,25))
a b g ol or
1: 3 13 0 5 12
2: 4 12 0 5 12
3: 5 19 0 5 12
4: 19 22 1 20 22
5: 20 23 1 20 22
6: 24 25 2 24 25