使用rnoaa软件包中的lcd函数时出现奇怪的tibble类
我最近更新了R、RStudio和tidyverse的最新版本,现在从rnoaa包运行ldc函数时出错。此错误仅在更新后开始使用rnoaa软件包中的lcd函数时出现奇怪的tibble类,r,purrr,rnoaa,R,Purrr,Rnoaa,我最近更新了R、RStudio和tidyverse的最新版本,现在从rnoaa包运行ldc函数时出错。此错误仅在更新后开始 R version 4.0.2 (2020-06-22) Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit) Running under: Windows 10 x64 (build 17763) Matrix products: default locale: [1] LC_COLLATE=English_United States.12
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] forcats_0.5.0 stringr_1.4.0 dplyr_1.0.1 purrr_0.3.4 readr_1.3.1 tidyr_1.1.1 tibble_3.0.3 ggplot2_3.3.2 tidyverse_1.3.0 rnoaa_1.1.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] tinytex_0.25 tidyselect_1.1.0 xfun_0.16 haven_2.3.1 colorspace_1.4-1 vctrs_0.3.2 generics_0.0.2 utf8_1.1.4 blob_1.2.1
[10] XML_3.99-0.5 rlang_0.4.7 pillar_1.4.6 withr_2.2.0 httpcode_0.3.0 glue_1.4.1 DBI_1.1.0 rappdirs_0.3.1 dbplyr_1.4.4
[19] modelr_0.1.8 readxl_1.3.1 lifecycle_0.2.0 munsell_0.5.0 gtable_0.3.0 cellranger_1.1.0 rvest_0.3.6 curl_4.3 fansi_0.4.1
[28] hoardr_0.5.2 triebeard_0.3.0 urltools_1.7.3 broom_0.7.0 Rcpp_1.0.5 scales_1.1.1 backports_1.1.8 jsonlite_1.7.0 fs_1.5.0
[37] gridExtra_2.3 hms_0.5.3 digest_0.6.25 stringi_1.4.6 grid_4.0.2 cli_2.0.2 tools_4.0.2 magrittr_1.5 crul_1.0.0
[46] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 ellipsis_0.3.1 xml2_1.3.2 reprex_0.3.0 lubridate_1.7.9 assertthat_0.2.1 httr_1.4.2 rstudioapi_0.11
[55] R6_2.4.1 compiler_4.0.2
以下是一个示例数据集:
Year <- seq(from = 2000, to = 2003)
Station <- c(72658014922)
dat <- crossing(Station, Year)
由于类中包含此奇怪的“lcd”,因此任何对RawData的调用都会出现以下错误:
dat <- dat %>%
mutate(RawData = map(RawData, ~mutate_all(., as.character)))
Error: Problem with `mutate()` input `RawData`.
x `x` must be a vector, not a `tbl_df/tbl/data.frame/lcd` object.
i Input `RawData` is `map(RawData, ~mutate_all(., as.character))`.
dat%
mutate(RawData=map(RawData,~mutate_all(,as.character)))
错误:“mutate()”输入“RawData”有问题。
x`x`必须是向量,而不是`tbl_df/tbl/data.frame/lcd`对象。
我输入的'RawData'是'map(RawData,~mutate_all(,as.character))`。
我可以通过运行以下代码绕过此错误:
dat <- dat %>%
mutate(RawData = lapply(RawData, as_tibble))
dat%
变异(RawData=lappy(RawData,作为不可复制的))
但是我很困惑为什么带有lcd函数的map2会给出类对象tbl\u df/tbl/data.frame/lcd
我真的很感激任何帮助理解这个错误 属性
lcd
正在创建问题
✖ x
必须是矢量,而不是tbl\u df/tbl/data.frame/lcd
对象
,可以转换为TIBLE,它应该可以工作
library(dplyr)
library(purrr)
dat %>%
mutate(RawData = map(RawData, ~
.x %>%
as_tibble %>%
mutate(across(everything(), as.character))))
如果我们检查函数
lcd
,它会在末尾添加lcd class属性
function (station, year, ...)
{
assert(station, c("character", "numeric", "integer"))
assert(year, c("character", "numeric", "integer"))
assert_range(year, 1901:format(Sys.Date(), "%Y"))
path <- lcd_get(station = station, year = year, ...)
tmp <- safe_read_csv(path)
names(tmp) <- tolower(names(tmp))
df <- tibble::as_tibble(tmp)
structure(df, class = c(class(df), "lcd")) # // adding the class attribute
}
功能(车站、年份等)
{
断言(station,c(“字符”、“数字”、“整数”))
断言(年份,c(“字符”、“数字”、“整数”))
断言范围(1901年:格式(Sys.Date(),%Y))
路径属性lcd
正在创建问题
✖ x
必须是矢量,而不是tbl\u df/tbl/data.frame/lcd
对象
,可以转换为TIBLE,它应该可以工作
library(dplyr)
library(purrr)
dat %>%
mutate(RawData = map(RawData, ~
.x %>%
as_tibble %>%
mutate(across(everything(), as.character))))
如果我们检查函数lcd
,它会在末尾添加lcd class属性
function (station, year, ...)
{
assert(station, c("character", "numeric", "integer"))
assert(year, c("character", "numeric", "integer"))
assert_range(year, 1901:format(Sys.Date(), "%Y"))
path <- lcd_get(station = station, year = year, ...)
tmp <- safe_read_csv(path)
names(tmp) <- tolower(names(tmp))
df <- tibble::as_tibble(tmp)
structure(df, class = c(class(df), "lcd")) # // adding the class attribute
}
功能(车站、年份等)
{
断言(station,c(“字符”、“数字”、“整数”))
断言(年份,c(“字符”、“数字”、“整数”))
断言范围(1901年:格式(Sys.Date(),%Y))
路径是的,这就是为什么我使用Lappy将列表元素转换为TIBLES。我试图理解的是为什么使用“lcd”正在添加到对象类中。在我更新tidyverse之前没有发生这种情况。@TaniaAlarcon您应用了函数lcd
,它正在创建该类。可能是更新了其中一个包以创建attributeOh,所以创建该类的是lcd函数,它可能与我更新tidyverse无关。我会联系rnoaa软件包创建者,询问这个恼人的类修改。谢谢!@TaniaAlarcon是的,这是对类的修改。您可以创建该函数的副本并删除最后一行(因为它是一个小函数)是的,这就是为什么我使用Lappy将列表元素转换为TIBLES。我试图理解的是为什么使用“lcd”正在添加到对象类中。在我更新tidyverse之前没有发生这种情况。@TaniaAlarcon您应用了函数lcd
,它正在创建该类。可能是更新了其中一个包以创建attributeOh,所以创建该类的是lcd函数,它可能与我更新tidyverse无关。我会联系rnoaa软件包创建者,询问这个恼人的类修改。谢谢!@TaniaAlarcon是的,这是对类的修改。您可以创建该函数的副本并删除最后一行(因为它是一个小函数)