R 将数据帧从一个先转换为另一个
我有一个像这样的数据框R 将数据帧从一个先转换为另一个,r,dataframe,R,Dataframe,我有一个像这样的数据框 > head(zeisel) gene_name ClusterName p 1 GNAI3 ABC 0.29914 2 GNAI3 ACBG 0.33417 3 GNAI3 ACMB 0.21984 4 GNAI3 ACNT1 0.14727 5 GNAI3 ACNT2 0.22205 6 GNAI3 ACOB 0.1
> head(zeisel)
gene_name ClusterName p
1 GNAI3 ABC 0.29914
2 GNAI3 ACBG 0.33417
3 GNAI3 ACMB 0.21984
4 GNAI3 ACNT1 0.14727
5 GNAI3 ACNT2 0.22205
6 GNAI3 ACOB 0.16913
我想将其转换为:
有办法做到这一点吗?我尝试先设置名称,但这将意味着迭代地遍历每一行
例如:
#get name of new df
cells <- as.data.frame(table(df$ClusterName))
#now create an empty dataframe.
unmelted_df <- setNames(data.frame(matrix(ncol = length(cells$Var1), nrow = 0)), as.character(cells$Var1))
#获取新df的名称
单元格一个选项是创建序列列,然后扩展成“宽”格式
library(tidyverse)
zeisel %>%
mutate(rn = 1) %>%
spread(ClusterName, p)
# gene_name rn ABC ACBG ACMB ACNT1 ACNT2 ACOB
#1 GNAI3 1 0.29914 0.33417 0.21984 0.14727 0.22205 0.16913
从较新版本的tidyr
,spread
将被弃用,并且可以使用在位的pivot\u wide
zeisel %>%
pivot_wider(names_from = 'ClusterName', values_from = 'p')
# A tibble: 1 x 7
# gene_name ABC ACBG ACMB ACNT1 ACNT2 ACOB
# <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#1 GNAI3 0.299 0.334 0.220 0.147 0.222 0.169
数据
zeisel Trytidyr::spread(df,ClusterName,p)
?为什么要使用mutate(rn=1)
?@Workhorse不需要它,但我认为首先您可能需要一个唯一的标识符来声明它是第一行(因为您只提供了数据集的头部)
library(data.table)
dcast(setDT(zeisel), gene_name ~ ClusterName, value.var = 'p')
# gene_name ABC ACBG ACMB ACNT1 ACNT2 ACOB
#1: GNAI3 0.29914 0.33417 0.21984 0.14727 0.22205 0.16913
zeisel <- structure(list(gene_name = c("GNAI3", "GNAI3", "GNAI3", "GNAI3",
"GNAI3", "GNAI3"), ClusterName = c("ABC", "ACBG", "ACMB", "ACNT1",
"ACNT2", "ACOB"), p = c(0.29914, 0.33417, 0.21984, 0.14727, 0.22205,
0.16913)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -6L))