R 最近邻平均值标记(空间点模式)标记平均值
我试图获得每个点上标记的平均值,计算每个点周围一定距离上的所有可用点,包括我们测量的点 我使用了带有缓冲区的markmean(){spatstats},但我不确定它是否在做我想做的事情 下面是我尝试做的一个简单示例:R 最近邻平均值标记(空间点模式)标记平均值,r,spatial,point,nearest-neighbor,spatstat,R,Spatial,Point,Nearest Neighbor,Spatstat,我试图获得每个点上标记的平均值,计算每个点周围一定距离上的所有可用点,包括我们测量的点 我使用了带有缓冲区的markmean(){spatstats},但我不确定它是否在做我想做的事情 下面是我尝试做的一个简单示例: library(spatstat) p <- c(1:25) #points ID x <- c(4,4,4,4,4,3,3,3,3,3,2,2,2,2,2,1,1,1,1,1,0,0,0,0,0) #x location y <- c(0,1,2,3,4,0,1
library(spatstat)
p <- c(1:25) #points ID
x <- c(4,4,4,4,4,3,3,3,3,3,2,2,2,2,2,1,1,1,1,1,0,0,0,0,0) #x location
y <- c(0,1,2,3,4,0,1,2,3,4,0,1,2,3,4,0,1,2,3,4,0,1,2,3,4) #y location
i <- c(0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,60,40,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0) #mark or value in each point
w <- owin(c(0,4), c(0,4))# window needed to create ppp
table <- data.frame(p,x,y,i)
ppptable.Mark <- ppp( table$x, table$y,
marks = table$i,
window = w )
meanmarkstable <- markmean (ppptable.Mark, sigma=1, at="points")
tableresults <- cbind(table,meanmarkstable )
你知道我为什么会得到这些结果吗?
如何正确计算特定缓冲区内每个点周围标记的平均值
提前非常感谢您的时间和帮助 函数
markmean
计算点的数字标记的平滑空间平均值。我相信您正在寻找函数markstat
,它计算每个点附近点的任何统计信息。该函数具有参数X
(标记的点模式)、fun
(在您的示例中使用的摘要函数--mean
),以及N
(通过距离每个点最近的N
点定义相邻点)或R
(通过每个点周围的半径定义相邻点,这是您想要的):
非常感谢您的投入!正是我想要的。
p x y i meanmarkstable
1 1 4 0 0 0.5588339
2 2 4 1 0 1.8035799
3 3 4 2 0 3.3992581
4 4 4 3 0 3.2959390
5 5 4 4 0 2.1132312
6 6 3 0 0 1.6559496
7 7 3 1 0 5.5518658
8 8 3 2 0 10.5182801
9 9 3 3 0 10.1597853
10 10 3 4 0 6.2832065
11 11 2 0 0 2.5529727
12 12 2 1 0 8.6038936
13 13 2 2 60 4.7103612
14 14 2 3 40 7.6160733
15 15 2 4 0 10.0581368
16 16 1 0 0 1.6560550
17 17 1 1 0 5.5599181
18 18 1 2 0 10.6956613
19 19 1 3 0 11.0335128
20 20 1 4 0 7.7616822
21 21 0 0 0 0.5589243
22 22 0 1 0 1.8099875
23 23 0 2 0 3.5421055
24 24 0 3 0 4.0856978
25 25 0 4 0 2.1128894
library(spatstat)
p <- 1:25 #points ID
x <- rep(4:0, each = 5) #x location
y <- rep(0:4, times = 5) #y location
i <- c(rep(0, 12), 60, 40, rep(0, 11)) #mark or value in each point
w <- square(4) # window needed to create ppp
table <- data.frame(p, x, y, i)
X <- with(table, ppp(x, y, marks = i, window = w))
meanmarkstable <- markstat (X, fun = mean, R=1)
tableresults <- cbind(table, neigh_mean = meanmarkstable)
p x y i neigh_mean
1 1 4 0 0 0
2 2 4 1 0 0
3 3 4 2 0 0
4 4 4 3 0 0
5 5 4 4 0 0
6 6 3 0 0 0
7 7 3 1 0 0
8 8 3 2 0 12
9 9 3 3 0 8
10 10 3 4 0 0
11 11 2 0 0 0
12 12 2 1 0 12
13 13 2 2 60 20
14 14 2 3 40 20
15 15 2 4 0 10
16 16 1 0 0 0
17 17 1 1 0 0
18 18 1 2 0 12
19 19 1 3 0 8
20 20 1 4 0 0
21 21 0 0 0 0
22 22 0 1 0 0
23 23 0 2 0 0
24 24 0 3 0 0
25 25 0 4 0 0